个人简介
方凌澜，1991年生于浙江金华。2013年于中国农业大学获得化学学士学位。毕业后就读于美国华盛顿大学，师从Dustin J. Maly教授，于2020年获得化学博士学位。随后加入美国斯坦福大学Eric T. Kool教授实验室开展博士后研究。将于2024年8月全职加入西湖大学担任助理教授、博士生导师，组建RNA化学生物学实验室。
研究方向
RNA化学生物学是一个集生物化学、有机化学、转录组学、大数据分析等多学科高度交叉的新型研究领域。我们的研究聚焦于通过研发新型分子探针和高通量测序技术，结合生物信息学等跨领域技能，系统性地发掘转录组中被多源小分子特异识别的位点，并深入探索这些分子作用对RNA的结构、功能和细胞功能的影响。我们将在分子层面释义RNA的小分子特异识别在维持细胞稳态中的关键作用，并揭示多种疾病的形成和分子毒理的诱因。这些研究将着力为相关的药物研发提供理论基础和应用场景。主要研究方向包括：
1. 开发高通量实验技术，精确甄别RNA-小分子相互作用对细胞稳态和信号通路的影响。
2. 研发新型分子探针和生物信息学方法，实现活细胞内RNA与小分子相互作用的大规模高精度探测。
3. 设计并合成新型多功能活性小分子，针对肿瘤、自身免疫和神经系统疾病实现对相关RNA功能的精准控制。
学术成果
方凌澜博士长期致力于发展活性小分子靶点探测相关的平台技术，在复杂生物系统中寻找外源小分子的活性结合位点，并在分子水平揭示外源小分子对于靶点的结构、功能以及所在细胞稳态和信号通路的影响。代表性的学术成果包括：
1. 建立高通量测序手段，首次在实现以单核苷酸分辨率大规模侦测小分子与人类转录组的相互作用。发现药物分子在转录组中存在普遍的“脱靶”现象，并揭示了药物-RNA互作诱发药物副作用的新机制。
2. 发展生物正交反应，利用小分子在活细胞中实现对蛋白质激酶的构象控制。并建立化学蛋白质组学手段，首次实现对受激酶构象控制的蛋白质互作网络的系统性表征。
3. 开发RNA合成后修饰反应，利用酰基咪唑小分子实现对RNA稳定性、信使RNA翻译和免疫效能的控制。
代表论文
1. Fang L, Velema WA, Lee Y, Xiao L, Mohsen MG, Kietrys AM, Kool ET, Pervasive Transcriptome Interactions of Protein-Targeted Drugs, Nat. Chem., 2023, 15, 1374-1383.
2. Fang L, Xiao L, Jun YW, Onishi Y, Kool ET, Reversible 2´-OH Acylation Enhances RNA stability, Nat. Chem., 2023, 15, 1296-1305.
3. Fang L, Chakraborty S, Dieter EM, Potter ZE, Lombard CK, Maly DJ, Chemoproteomic Method for Profiling Inhibitor-Bound Kinase Complexes, J. Am. Chem. Soc., 2019, 141, 30, 11912-11922.
4. Fang L, Kool ET, Reactivity-Based RNA Profiling for Analyzing Transcriptome Interactions of Small Molecules in Human Cells, STAR Protocols, 2023, 4, 102670.
5. Fang L, Vilas-Boas J, Chakraborty S, Potter ZE, Register AC, Seeliger MA, Maly DJ, How ATP-Competitive Inhibitors Allosterically Modulate Tyrosine Kinases That Contain a Src-like Regulatory Architecture, ACS Chem. Biol., 2020, 15, 7, 2005-2016.
其它已发表论文：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/?term=linglan%20fang
联系方式
电子邮箱：fanglinglan@westlake.edu.cn
课题组目前正在组建中，面向海内外诚邀有责任心、好奇心、耐心的博士后、研究助理和博士研究生一起挑战前沿的基础与应用研究。我们将构建一个多学科高度交叉的研究团队，方向包括化学生物学、有机化学、转录组学、生物化学、分子生物学、大数据分析、生物信息学（招聘信息如下）。
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